Вопрос - о взаиморасчетах, причем - на большую сумму. Обратитесь к юристу, имеющему опыт в данной сфере. Проведите сверку взаиморасчетов, составьте акт сверки. Для составления договоров - используйте конец первой части
Гражданского кодекса - способы прекращения обязательств (зачет, новация) и перемена лиц в обязательстве (возможно и цессия Вам подойдет) . Суд здесь не нужен - спора я не усматриваю. Если Вы в Москве - пишите мне в личку, приглашу на встречу. Понадобится следующая документация (копии) : все договора и акты сдачи работ с заказчиком, вся переписка, в т. ч. факсы и мэйлы по этому вопросу, вся первичка по бухгалтерии - все расчеты, акт сверки, акты распределения площадей объекта, и иная документация, которую Вы сочтете необходимой. Важно - чтобы Ваш Заказчик еще не успел распорядиться будущими квартирами (не назаключал договоров долевого участия с гражданами) , иначе произойдет т. н. двойная продажа, влекущая уже уголовное разбирательство.