1. Требование выставлять счет-фактуру относится только к плательщикам НДС. УСНщики таковыми не являются, счет-фактуру они не рисуют2. Если «упрощенец» выставит счет-фактуру (иногда партнеры просят и некоторые идут на встречу, это можно...), выделив сумму НДС, тогда он обязан будет заплатить НДС в бюджет (п. 5
ст. 173 НК РФ), придется еще и сдать декларацию по НДС. (если пригодится - письмо Минфина России от 10.02.06 № 03-11-04/2/33, там тоже самое сказано)