С 30.09.2010 вступил в силу Федеральный закон от 28.09.2010 N 244-ФЗ "Об инновационном центре "Сколково" (далее - Закон N 244-ФЗ). С целью создания благоприятных условий для осуществления деятельности участниками проекта Федеральным законом от 28.09.2010 N 243-ФЗ внесены изменения и в НК РФ, в частности, введена статья 145.1 НК РФ, предусматривающая освобождение участников инновационного проекта "Сколково" от уплаты НДС. Согласно пункту 8 статьи 2 Закона N 244-ФЗ участник проекта - российское юридическое лицо, созданное исключительно в целях осуществления исследовательской деятельности в соответствии с Законом N 244-ФЗ и получившее в соответствии с Законом N 244-ФЗ статус участника проекта. Ныне действующий порядок представления расчета совокупного размера прибыли введен с 29.11.2011 и в силу статьи 8 Федерального закона от 28.11.2011 N 339-ФЗ "О внесении изменений в отдельные законодательные акты Российской Федерации" распространяется на правоотношения, возникшие с 01.01.2011. Согласно ранее действовавшей редакции абзаца 4 пункта 6 статьи 145.1 НК РФ расчет представлялся с 1-го числа года, в котором объем выручки от реализации превысил 1 млрд. руб. Форма такого расчета, как и форма уведомления участника проекта утверждены Приказом Минфина России от 30.12.2010 N 196н (далее - Приказ N 196н). Ныне действующая редакция Приказа N 196н вступила в силу с 14.09.2011. В письме от 16.01.2012 N 03-07-14/03 Минфин России отметил отсутствие оснований у организации, уведомившей налоговый орган об использовании права, предусмотренного пунктом 1 статьи 145.1 НК РФ, выделять суммы налога на добавленную стоимость в документах, предъявляемых покупателям. При этом исходя из письма Минфина России от 24.11.2011 N 03-03-06/1/779 право на освобождение от обязанностей налогоплательщика, связанных с исчислением и уплатой налога на добавленную стоимость, предоставленное организации, получившей статус участника проекта, не означает освобождения от других обязанностей налогоплательщика налога на добавленную стоимость.В связи с изложенным участники проекта должны представлять в налоговый орган налоговую декларацию по налогу на добавленную стоимость в общеустановленном порядке. Позднее финансовое ведомство конкретизировало свои разъяснения (письмо от 12.09.2012 N 03-07-09/129): освобождение участников проекта от обязанности составлять счета-фактуры статьей 145.1 НК РФ не предусмотрено. Такого освобождения от обязанности составлять счета-фактуры для налогоплательщиков, являющихся участниками вышеуказанного проекта, не предусмотрено и положениями статьи 168 НК РФ.Учитывая изложенное, участникам данного проекта, использующим в соответствии со статьей 145.1 НК РФ право на освобождение от обязанностей налогоплательщика, связанных с исчислением и уплатой налога на добавленную стоимость, следует составлять счета-фактуры в общеустановленном порядке. При этом данные налогоплательщики налог на добавленную стоимость покупателям предъявлять не должны. Поэтому в графу 7 "Налоговая ставка" счета-фактуры и в графу 8 "Сумма налога, предъявляемая покупателю" счета-фактуры вносится запись "без НДС".